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【干貨分享】第二期:顏色補償那些事兒

多重熒光PCR已經(jīng)廣泛地使用在各種病原體的檢測中,這得益于熒光PCR檢測儀多通道熒光采集的功能。

2022-01-20

多重熒光PCR已經(jīng)廣泛地使用在各種病原體的檢測中,這得益于熒光PCR檢測儀多通道熒光采集的功能。在使用羅氏480(LC1/LC2/Z cobas)進行多重檢測時,往往會遇到需要做顏色補償?shù)那闆r,那么今天小編就與您聊一聊關(guān)于顏色補償?shù)哪切┦聝簙

為什么羅氏480需要做顏色補償?

首先,我們來看一下羅氏480的激發(fā)波長及檢測波長
LightCycler1的濾光片:

圖片.png

LightCycler2的濾光片:

圖片.png

熒光通道發(fā)射光譜拋物線示意圖:

圖片.png

從上圖可以看出在一個多色反應中,由于各染料的發(fā)射光的波長有重疊,導致一個通道能夠捕獲到另一個通道所檢測的染料信號。這種熒光信號的溢出會導致無效的數(shù)據(jù)產(chǎn)生,即我們常說的“串色”或“串孔”現(xiàn)象。

由于每臺儀器的濾光片是固定的,無法改變其激發(fā)光與檢測光波長;想要校正這種溢出,在運行這個實驗或分析這個數(shù)據(jù)時,就需要應用顏色補償目標。當用顏色補償目標時,LightCycler 算法會使用補償實驗文件中的數(shù)據(jù)來補償熒光值的溢出,補償后即可以看到每個通道特定的信號。


什么時候要做顏色補償?
只有當多個熒光通道(比如VIC和ROX同時使用)用于數(shù)據(jù)分析時才有必要采用顏色補償,當使用單通道時無需采用顏色補償。
另外,由于合成的探針的熒光染料各個廠家之間存在一定的差異性,因此,不同廠家之間的顏色補償數(shù)據(jù)一般不通用。在更換檢測試劑盒時,需要進行對應廠家試劑的顏色補償實驗哦~

如何使用顏色補償?

首先,按顏色補償說明書進行顏色補償實驗
其次,進行常規(guī)的檢測實驗
最后,在每次檢測完畢的分析界面調(diào)用補償數(shù)據(jù),具體操作如下:
A. 點擊Color Comp 旁下拉菜單

圖片.png

B. 選擇In Database

圖片.png

C. 選擇補償實驗數(shù)據(jù)

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D. 最后重新計算即可
E. 補償前后結(jié)果對比:

圖片.png

補償前

 圖片.png

補償后

從補償前后結(jié)果來看,即可確定VIC通道中的翹尾,是ROX通道串孔所致。羅氏480分析界面調(diào)用補償文件的方法也是一鍵操作,十分簡便。針對一個廠家的試劑,顏色補償實驗只需做一次,數(shù)據(jù)便可一直使用。